W spektakularnym finale epickiej sagi o „Więźniu labiryntu” Thomas staje na czele grupy zbiegłych Streferów, którzy wyruszają z ostateczną misją. Jeśli chcą ocalić swych przyjaciół, muszą wkraść się do legendarnego Ostatniego Miasta – kontrolowanego przez DRESZCZ labiryntu, który kryje w sobie najniebezpieczniejszą z dotychczasowych pułapek. Ci, którzy wyjdą z niej żywi, poznają odpowiedzi na pytania, które Streferzy zadają sobie od chwili, gdy znaleźli się w pierwszym labiryncie.
Thomas (Dylan O’Brien) przewodzi grupie zbiegłych Streferów w ich ostatniej misji. By ocalić przyjaciół, muszą przeniknąć do legendarnego Ostatniego Miasta - kontrolowanego przez organizację "Dreszcz labiryntu", który może okazać się najbardziej niebezpieczny z dotychczasowych. Każdy, kto z niego wyjdzie cało, pozna odpowiedź na pytanie, które Streferzy stawiają sobie od chwili, gdy znaleźli się w pierwszym labiryncie.